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重磅來(lái)襲:歐盟率先出臺(tái)NGS診斷指南(38條聲明,6大方向)

2015-12-15 作者: 瀏覽數(shù):974

  下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)使快速讀取患者DNA中成千上萬(wàn)的堿基序列成為了可能,NGS的快速崛起為遺傳診斷開(kāi)啟了一個(gè)嶄新的時(shí)代。然而,新技術(shù)的發(fā)展也帶來(lái)了巨大的挑戰(zhàn),包括技術(shù)水平、數(shù)據(jù)管理和檢測(cè)結(jié)果的解釋與咨詢?nèi)矫鎺?lái)的挑戰(zhàn)。將NGS數(shù)據(jù)應(yīng)用于診斷領(lǐng)域之前,尚且還有很多問(wèn)題需要解決。

  在這種背景下,EuroGentest和歐盟人類(lèi)遺傳學(xué)會(huì)對(duì)基于NGS的遺傳病診斷進(jìn)行評(píng)估和驗(yàn)證,并制定了NGS診斷指南。該指南經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)室遺傳學(xué)家、生物信息學(xué)家、臨床遺傳學(xué)家、企業(yè)界和患者代表及其他人類(lèi)遺傳領(lǐng)域相關(guān)人員的共同討論,最終由實(shí)驗(yàn)室遺傳學(xué)家和生物信息學(xué)家制定。該指南可做為補(bǔ)充材料,幫助診斷實(shí)驗(yàn)室有效應(yīng)用NGS技術(shù)并指導(dǎo)NGS的資質(zhì)認(rèn)證。

  該指南主要針對(duì)罕見(jiàn)病和單基因疾病的NGS診斷,主要專(zhuān)注于基因panels的靶向分析、特定的捕獲分析以及從全外顯子測(cè)序中提取可用數(shù)據(jù)。理論上或許很快就能從全基因組測(cè)序中提取類(lèi)似的信息,在這種情況下,該指南將仍適用,但由于全基因組測(cè)序還能檢測(cè)到其他疾病的分子特性,因此測(cè)序深度應(yīng)當(dāng)相應(yīng)延長(zhǎng)。該指南涵蓋了過(guò)去幾年關(guān)于NGS的指導(dǎo)方針,但比舊版多了一些新見(jiàn)解,其中最重要的新特性是NGS診斷測(cè)試的“評(píng)價(jià)系統(tǒng)”。

  該指南在三次NGS與診斷的重大討論會(huì)中生成。第一次研討會(huì)于2013年2月25日-26日在比利Leuven舉行,2013年3月7-8日在EuroGentest科學(xué)大會(huì)上NGS指南初步意見(jiàn)形成;第二次討論會(huì)于2013年10月1日-2日在Leuven舉行,主要對(duì)NGS診斷指南進(jìn)行編寫(xiě),2013年11月21日-22日在Nijmegen敲定該指南;第三次討論會(huì)中,邀請(qǐng)了更多的相關(guān)人員參與,他們被邀請(qǐng)對(duì)指南進(jìn)行評(píng)論并作評(píng)述報(bào)告,指南出版前遞交歐洲人類(lèi)遺傳學(xué)董事會(huì)審核,最終該指南于2015年7月正式通過(guò)審批并刊出,并獲得了基因診斷聯(lián)盟的高度稱贊,對(duì)歐洲NGS診斷產(chǎn)業(yè)的質(zhì)量監(jiān)督有重要意義。

  該指南從目前發(fā)展水平、診斷/臨床的效用、知情同意書(shū)及對(duì)患者和醫(yī)生的通知、驗(yàn)證、報(bào)告、研究與診斷之間的區(qū)別六個(gè)方向做了38個(gè)聲明,并發(fā)表于《歐洲人類(lèi)遺傳學(xué)雜志》上。

  一、目前發(fā)展水平

  從某種意義上說(shuō),由于技術(shù)發(fā)展迅猛導(dǎo)致了NGS平臺(tái)出現(xiàn)不穩(wěn)定的現(xiàn)狀。然而,這不能作為阻止NGS應(yīng)用于診斷領(lǐng)域的理由,因?yàn)镹GS給患者帶來(lái)了潛在的利益。阻止NGS過(guò)早用于診斷的原因只能是其質(zhì)量差,未通過(guò)驗(yàn)證就進(jìn)入臨床診斷對(duì)患者而言具有威脅性,同時(shí)也是不可接受的。

  聲明1:未根據(jù)最新指南要求進(jìn)行可接受性驗(yàn)證測(cè)試,NGS不應(yīng)進(jìn)入臨床實(shí)踐中。

  診斷測(cè)試的目的是排除還是確認(rèn)診斷應(yīng)事先定義好,因?yàn)榕懦痛_診的區(qū)別很重要,這種區(qū)別主要取決于測(cè)試的完整性和授權(quán)性,不僅僅涉及測(cè)試技術(shù)的不同設(shè)置還包括診斷的不同意見(jiàn)。

  聲明2:實(shí)驗(yàn)室必須確定即將進(jìn)行的測(cè)試是用于排除診斷還是證實(shí)診斷。

  二、診斷/臨床的效應(yīng)

  NGS應(yīng)用于診斷領(lǐng)域最大的優(yōu)勢(shì)是可在相對(duì)短的時(shí)間內(nèi)和相對(duì)低的成本下檢測(cè)多個(gè)基因,從而得出更多的分子診斷信息。NGS的局限性在于其對(duì)平臺(tái)及濃縮方法的依賴,且一直以來(lái)認(rèn)為濃縮方法和測(cè)序平臺(tái)容易受影響,因而額外的測(cè)試對(duì)高質(zhì)量診斷來(lái)說(shuō)很重要。

  聲明3:測(cè)試或分析的目的和實(shí)用性必須在驗(yàn)證起始時(shí)進(jìn)行討論,且驗(yàn)證報(bào)告中應(yīng)包括摘要總結(jié)。

  診斷的效率必須明確,因?yàn)橹虏∽儺惖母怕时粯?biāo)識(shí)了才能做出相應(yīng)的分子診斷。這個(gè)概率值由病人群為單位進(jìn)行計(jì)算,從臨床角度確定了NGS的性能,是反應(yīng)測(cè)試效率和臨床應(yīng)用的很好指標(biāo)。

  聲明4:當(dāng)診斷實(shí)驗(yàn)室考慮引進(jìn)NGS監(jiān)測(cè)時(shí),首先必須考慮它的診斷效率。

  在實(shí)踐中,診斷實(shí)驗(yàn)室將提供更好的基因panels,在開(kāi)發(fā)診斷測(cè)試時(shí)必須確定將一個(gè)基因移植到panels上所需的條件。在理想情況下,該問(wèn)題應(yīng)以多學(xué)科的方式進(jìn)行一級(jí)處理,目標(biāo)是編譯用于診斷的基因列表。

  聲明5:出于診斷目的,只有異常基因型和與病理相關(guān)的已知基因(發(fā)表或證實(shí)過(guò)的)才能納入分析中。

  一直以來(lái)人們都將與身理缺陷相關(guān)基因稱為“核心基因”,從Sanger技術(shù)發(fā)展NGS技術(shù),測(cè)序的靈敏度不應(yīng)降低。例如BRCA1和BRAC2基因,Sanger測(cè)序技術(shù)結(jié)合缺失/重復(fù)分析可使靈敏度達(dá)99%,以此類(lèi)推該方法對(duì)其他基因的診斷效率也應(yīng)該很高。理論上增加其他基因的檢測(cè)會(huì)增加診斷率,但不應(yīng)以犧牲原有的突變檢測(cè)為代價(jià)。檢出率的提高是決定核心基因檢測(cè)列表和處理缺口的關(guān)鍵因素。

  聲明6:出于比對(duì),為了避免不負(fù)責(zé)任的測(cè)試,為了患者的利益,“核心疾病基因列表”應(yīng)由臨床和實(shí)驗(yàn)室專(zhuān)家制定。

  若不考慮本指南,實(shí)驗(yàn)室可用不同參數(shù)的NGS檢測(cè)(技術(shù)和診斷)。事實(shí)上,有太多的變量無(wú)法通過(guò)固定的指南來(lái)指導(dǎo)檢測(cè)。因此我們?yōu)镹GS檢測(cè)提出一個(gè)簡(jiǎn)單的評(píng)分系統(tǒng),該系統(tǒng)可公平打分并對(duì)不同實(shí)驗(yàn)室提供的NGS檢測(cè)進(jìn)行簡(jiǎn)單比對(duì)。

  A類(lèi)檢測(cè):實(shí)驗(yàn)室保證編碼區(qū)和內(nèi)含子區(qū)序列的可靠?jī)?nèi)參或識(shí)別變體大于99%,并用Sangger測(cè)序(或其他互補(bǔ)的測(cè)序分析)進(jìn)行缺口填補(bǔ),根據(jù)所使用的平臺(tái),選擇額外的分析,如進(jìn)行均聚物延伸的分析。

  B類(lèi)檢測(cè):實(shí)驗(yàn)室能正確描述哪些區(qū)域能在可靠?jī)?nèi)參或識(shí)別變體大于99%的條件下測(cè)序,并用Sangger(或其他)測(cè)序方法進(jìn)行缺口填補(bǔ)。

  C類(lèi)測(cè)試:C類(lèi)測(cè)試僅僅基于NGS的試驗(yàn),沒(méi)有額外的Sangger(或其他)測(cè)序試驗(yàn)。

  聲明7:簡(jiǎn)單的評(píng)分系統(tǒng)基于檢測(cè)覆蓋面和診斷率,可對(duì)不同實(shí)驗(yàn)室提供的檢測(cè)進(jìn)行比較。

  三、知情同意書(shū)及對(duì)患者和醫(yī)生的通知

  基于NGS的診斷取決于實(shí)驗(yàn)室所用的程序、平臺(tái)、數(shù)據(jù)過(guò)濾和數(shù)據(jù)儲(chǔ)存。至關(guān)重要的是,咨詢醫(yī)生應(yīng)當(dāng)被完全告知檢測(cè)的局限性及檢測(cè)可能出現(xiàn)的不良影響。

  聲明8:實(shí)驗(yàn)室提供的每個(gè)NGS檢測(cè)應(yīng)明確以下幾點(diǎn):明確目標(biāo)疾病,明確所檢測(cè)的基因名稱,明確可報(bào)告范圍,明確分析敏感度和特異性,如果可以,還應(yīng)明確與臨床表型無(wú)關(guān)但與所檢測(cè)的基因相關(guān)的疾病。

  NGS診斷的應(yīng)用性主要依賴于直觀結(jié)果和二次結(jié)果。盡管直觀結(jié)果可從與檢測(cè)疾病相關(guān)的基因信息中獲得,但二次結(jié)果卻隱藏在與檢測(cè)疾病無(wú)關(guān)的疾病基因中。

  聲明9:診斷實(shí)驗(yàn)室的分析途徑應(yīng)聚焦于處于調(diào)查研究中的基因pannel以避免二次結(jié)果的發(fā)生,并進(jìn)行相應(yīng)的驗(yàn)證。

  直觀結(jié)果在基因pannel中的概率很低,一般依賴于疾病基因。然而,檢測(cè)結(jié)果還有可能反映出隱性雜合突變,根據(jù)此還可判斷疾病的攜帶狀況。這將對(duì)后續(xù)的咨詢、生育選擇等產(chǎn)生影響。

  聲明10:實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該提供直觀結(jié)果的信息。

  在執(zhí)行NGS診斷檢測(cè)之前,臨床(遺傳)中心需要建立一個(gè)“直觀結(jié)果和二次結(jié)果的協(xié)議”,該協(xié)議必須與倫理委員會(huì)的意見(jiàn)相符,應(yīng)明確——在實(shí)驗(yàn)室、研究所或國(guó)家層面上——除了最初的診斷結(jié)果,患者對(duì)檢測(cè)出來(lái)的額外結(jié)果的告知是否有選擇決定權(quán),還應(yīng)詳細(xì)說(shuō)明檢測(cè)直觀結(jié)果與疾病攜帶狀況是否出現(xiàn)在檢測(cè)報(bào)告中。實(shí)驗(yàn)室必須確保能妥善管理協(xié)議中的每一條選項(xiàng)。

  聲明11:關(guān)于與目標(biāo)疾病無(wú)關(guān)的其他疾病攜帶狀態(tài)和二次結(jié)果是否被告知的選項(xiàng)協(xié)議,如果臨床中心或?qū)嶒?yàn)室決定為患者提供,那么該協(xié)議應(yīng)該包含所有的邏輯性。

  此外,檢測(cè)前遺傳咨詢是必要的,且應(yīng)包括預(yù)期結(jié)果和潛在的直觀結(jié)果與二次結(jié)果的討論,并提供足夠的信息。

  聲明12:應(yīng)讓患者清楚當(dāng)?shù)貙?duì)直觀結(jié)果與二次結(jié)果的管理政策。

  聲明13:建議給患者提供一份書(shū)面說(shuō)明書(shū)或在線可用信息說(shuō)明。

  四、驗(yàn)證

  樣品的質(zhì)量與許多參數(shù)有關(guān),包括數(shù)據(jù)的產(chǎn)量、PCR拷貝和覆蓋的比例。在診斷設(shè)置中,只有好的樣本才是必須分析的,因此對(duì)高質(zhì)量的目標(biāo)基因pannel、外顯子或基因組的標(biāo)準(zhǔn)定義十分必要。

  聲明14:應(yīng)準(zhǔn)確描述診斷程序中所有的NGS質(zhì)量測(cè)量指標(biāo)。

  NGS技術(shù)要求監(jiān)測(cè)特定的run和特定分析/樣本的特性。監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)無(wú)需做成報(bào)告但可用于后續(xù)的驗(yàn)證。

  聲明15:診斷實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對(duì)平臺(tái)、所有的分析和所有的樣本設(shè)置一個(gè)相關(guān)質(zhì)量度量結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫(kù)。

  由于NGS工作流程非常復(fù)雜,因此應(yīng)建立樣本的追蹤方法,包括在實(shí)驗(yàn)室和計(jì)算分析中實(shí)施并聯(lián)法。

  聲明16:在評(píng)估分析處理中包括平臺(tái)驗(yàn)證過(guò)程應(yīng)建立樣本追蹤方法和設(shè)置樣本識(shí)別條形碼。

  在平臺(tái)驗(yàn)證過(guò)程中,實(shí)驗(yàn)室必須確保所有的設(shè)備和試劑都與制造商的要求相符。必須明確每種技術(shù)的局限性,并在開(kāi)發(fā)測(cè)試和數(shù)據(jù)分析中將其考慮在內(nèi)。實(shí)驗(yàn)室必須能區(qū)分附屬于平臺(tái)、特殊檢測(cè)或分析流程的特性。

  聲明17:平臺(tái)驗(yàn)證應(yīng)包括精準(zhǔn)度和精密度,且通過(guò)驗(yàn)證的平臺(tái)工作結(jié)果無(wú)需其他方法來(lái)重復(fù)驗(yàn)證。

  顯然每種測(cè)序技術(shù)都存在著優(yōu)缺點(diǎn),生物信息學(xué)工具必須能反映這些特征。

  聲明18:生物信息學(xué)流程必須針對(duì)所使用的技術(shù)平臺(tái)。

  在流程的驗(yàn)證期間,診斷規(guī)范必須通過(guò)敏感和特性的分析評(píng)估。例如,SNP檢測(cè)最佳化的算法對(duì)(小片段)插入/刪除的檢測(cè)準(zhǔn)確性不高。實(shí)驗(yàn)室必須證實(shí)意識(shí)到這些特性以及所使用的變異檢測(cè)流程能滿足當(dāng)前診斷分析。

  聲明19:在不同的流程驗(yàn)證中,必須為每種類(lèi)型的變異建立敏感性和特異性分析。

  任何化學(xué)成分的改變、濃縮方法或生物信息學(xué)分析平臺(tái)應(yīng)該保證后續(xù)的有效性。

  聲明20:診斷實(shí)驗(yàn)室必須驗(yàn)證所有的生物信息學(xué)流程(公用工具或商業(yè)軟件包)的標(biāo)準(zhǔn)信息設(shè)置,以確保相關(guān)數(shù)據(jù)更改后(新版本)及時(shí)跟進(jìn)。

  包含所有相關(guān)變異的本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)提供了識(shí)別特定工作平臺(tái)的工件、跟蹤驗(yàn)證結(jié)果、提供特異性位點(diǎn)數(shù)據(jù)和meta-分析交換代理(exchange proxy)的重要工具。通常這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)允許進(jìn)一步注釋(假陽(yáng)性、已知突變、隔離變體等),這將大大簡(jiǎn)化診斷過(guò)程。

  聲明21:診斷實(shí)驗(yàn)室應(yīng)使用當(dāng)前注釋相關(guān)變異體的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫(kù)。

  數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)使用標(biāo)準(zhǔn)的開(kāi)放性格式如FASTQ、BAM或VCF,這些格式的數(shù)據(jù)可與其他實(shí)驗(yàn)室共享。當(dāng)存儲(chǔ)分析結(jié)果時(shí),應(yīng)額外保存完整的日志文件。日志文件應(yīng)盡可能完整以保證FASTQ數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為整個(gè)診斷報(bào)告的可復(fù)寫(xiě)性。遺憾的是,關(guān)于如何存儲(chǔ)目前國(guó)際上還沒(méi)有共識(shí)。然而,存儲(chǔ)必須符合國(guó)家的需求和常識(shí)。

  聲明22:診斷試驗(yàn)必須對(duì)所有相關(guān)數(shù)據(jù)的長(zhǎng)期存儲(chǔ)采取相應(yīng)措施。

  在啟動(dòng)任何試驗(yàn)之前,必須確定好臨床目標(biāo)(包括編碼區(qū)和保守的剪接位點(diǎn)),臨床目標(biāo)取決于診斷測(cè)試與所定義的基因pannel。

  聲明23:可報(bào)告范圍必須在測(cè)試開(kāi)發(fā)過(guò)程中確定,且對(duì)臨床醫(yī)生具有可用性(報(bào)告或傳達(dá)數(shù)字)。

  聲明24:“可報(bào)告范圍”的要求取決于診斷分析的目的。

  例如,外顯子測(cè)序分析的目的是獲得高效率的診斷,不需要進(jìn)行額外分析來(lái)獲取所有基因組所覆蓋的信息,但需要與臨床醫(yī)生清晰溝通這種測(cè)試方法不能用于排除特定的臨床診斷。診斷測(cè)試必須進(jìn)行準(zhǔn)確性、靈敏性和特異性的分析評(píng)估。原則上,這些評(píng)估并不是新穎的,且被認(rèn)為很麻煩,但I(xiàn)SO標(biāo)準(zhǔn)對(duì)其的要求十分嚴(yán)格。

  聲明25:當(dāng)測(cè)試發(fā)生重大變化時(shí),必須對(duì)質(zhì)量參數(shù)進(jìn)行檢查,且必須重新上樣檢測(cè)。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)事先定義好當(dāng)測(cè)試方法更新或升級(jí)后哪種類(lèi)型的樣本要重新分析及分析次數(shù)。

  五、報(bào)告

  NGS檢測(cè)結(jié)果報(bào)告的清晰性和一致性至關(guān)重要,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)室的報(bào)告可能被專(zhuān)家和非專(zhuān)家閱讀。從實(shí)用的角度來(lái)看,臨床上的重要結(jié)論、相關(guān)測(cè)試和測(cè)試質(zhì)量數(shù)據(jù)應(yīng)寫(xiě)在報(bào)告的首頁(yè)。

  聲明26:NGS的分析報(bào)告應(yīng)該對(duì)患者的鑒別診斷進(jìn)行總結(jié),簡(jiǎn)要描述測(cè)試,總結(jié)結(jié)果,將主要結(jié)果放于報(bào)告首頁(yè)。

  所有致病(5類(lèi))或可能致病(4類(lèi))的變異必須包含在報(bào)告中,由當(dāng)?shù)卣邲Q定是否報(bào)告未分類(lèi)的變異(UVs-3類(lèi)),且實(shí)驗(yàn)室科學(xué)家及臨床醫(yī)生必須清楚UVs-3類(lèi)。

  聲明27:關(guān)于基因變異報(bào)告的當(dāng)?shù)卣?符合國(guó)際建議)應(yīng)由實(shí)驗(yàn)室在分析之前建立和制定。

  聲明28:必須收集UVs數(shù)據(jù),最終目的是將這些變異體進(jìn)行分類(lèi)。

  需發(fā)起收集和分享可用信息的群體活動(dòng),最終目的是將變異體絕對(duì)分類(lèi)為致病性(5類(lèi))或良性(1類(lèi))。被實(shí)驗(yàn)室或研究所采納的與直接結(jié)果和二次結(jié)果相關(guān)的政策必須體現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)室的實(shí)踐和報(bào)告中。

  聲明29:在啟動(dòng)檢測(cè)之前,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)有一個(gè)關(guān)于訪問(wèn)直接結(jié)果和二次結(jié)果的明確協(xié)議。

  診斷實(shí)驗(yàn)室不應(yīng)該因舊數(shù)據(jù)的分析請(qǐng)求而超載。診斷請(qǐng)求應(yīng)是包含合適時(shí)間與合適地點(diǎn)的合同,診斷試驗(yàn)只能在給定的時(shí)間提供已知的和經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的信息。

  聲明30:一般情況下實(shí)驗(yàn)室不會(huì)系統(tǒng)性地重分析舊數(shù)據(jù)并生成新報(bào)告,即使與疾病相關(guān)的核心基因發(fā)生了變化。

  但在特殊情形下(該情形由疾病的實(shí)驗(yàn)室或社區(qū)專(zhuān)家決定,如變體類(lèi)型發(fā)生變化時(shí)),實(shí)驗(yàn)室有責(zé)任重新分析數(shù)據(jù),在新證據(jù)的基礎(chǔ)上生成新報(bào)告,并重新聯(lián)系相關(guān)臨床醫(yī)生和患者,告知變異新?tīng)顟B(tài)可能帶來(lái)的影響,這種情況下,建立病人與變異體的有效連接系統(tǒng)十分有必要,該系統(tǒng)在變異體重新分類(lèi)時(shí)可對(duì)受影響病例進(jìn)行檢索。

  聲明31:為了管理疾病變異體,實(shí)驗(yàn)室必須建立本地變量數(shù)據(jù)庫(kù),為不同疾病的檢測(cè)提供臨床依據(jù)。

  六、研究和診斷之間的區(qū)別

  隨著全基因組測(cè)序在研究和診斷領(lǐng)域的可能性增加,兩者之間的界線也越來(lái)越模糊,因此描述對(duì)患者診斷數(shù)據(jù)的用途以及確定特定類(lèi)型的分析研究是必要的。然而,這并不排除對(duì)診斷結(jié)果進(jìn)一步研究的建議,但研究與診斷之間的區(qū)別必須時(shí)刻保持清晰。

  聲明32:任何診斷測(cè)試都是為了回答與患者醫(yī)療條件相關(guān)的臨床問(wèn)題。

  聲明33:研究測(cè)試是一種驅(qū)動(dòng)假設(shè),結(jié)果可能僅限于參與研究的患者的臨床效應(yīng)。

  聲明34:通過(guò)分析外顯子或基因組得出的診斷測(cè)試結(jié)果可假設(shè)生成。

  在診斷過(guò)程中,使用NGS技術(shù)獲得的外顯子測(cè)序和基因組數(shù)據(jù)是可以接受的,如果目標(biāo)是獲得一個(gè)遺傳診斷那么檢測(cè)將局限于與該疾病相關(guān)的已知基因。

  聲明35:當(dāng)以單一患者的診斷為的目的診斷檢測(cè)應(yīng)在獲認(rèn)可的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行。

  當(dāng)參與一個(gè)研究項(xiàng)目時(shí),患者及其家庭必須意識(shí)到這個(gè)項(xiàng)目可能會(huì)披露其遺傳性疾病的信息。在研究中,臨床相關(guān)的結(jié)果必須在診斷確定后才能納入患者的醫(yī)療記錄中。

  聲明36:研究結(jié)果必須在通過(guò)認(rèn)證的實(shí)驗(yàn)室確定后方可轉(zhuǎn)移至患者身上。

  大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室都建立本地測(cè)序/分析樣本變異頻率數(shù)據(jù)庫(kù)以便易于進(jìn)行變異解釋。這類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù)不包含任何敏感的信息。出于隱私原則考慮,不掂量這些數(shù)據(jù)對(duì)診斷和醫(yī)療改善的重要性。

  聲明37:所有來(lái)自健康個(gè)體的診斷測(cè)試或研究測(cè)試的變異頻率都應(yīng)共享。

  理想情況下,疾病檢測(cè)中所有與基因相關(guān)的變體應(yīng)該提交至致病性變異數(shù)據(jù)庫(kù),并與患者的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合。用于變異體分類(lèi)的標(biāo)準(zhǔn)和參數(shù)應(yīng)清楚描述。

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